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1956年 周恩來總理親自提議、主持、制定我國《十二年科學技術發展規劃》，選定了“計算機、電子學、半導體、自動化”作為“發展規劃”的四項緊急措施，并制定了計算機科研、生產、教育發展計劃,并提出立即籌建研究機構。中國科學院立刻貫徹落實，抓緊籌建研究所。從6月上旬開始抽調專職人員，從事計算所的籌備工作并組建籌備委員會。6月19日，華羅庚主持召開了第一次籌備委員會會議。

1956年8月25日國務院正式批準成立中國科學院計算技術研究所籌備委員會，主任委員華羅庚（兼），副主任委員何津（兼）、王正（兼）、閻沛霖，委員趙訪熊（兼）、閔乃大、蔣士飛（兼）、吳幾康、周壽憲（兼）、范新弼、徐獻瑜（兼）、夏培肅、張效祥（兼）、張克明。從此，誕生了我國第一個計算機科學技術研究所，她肩負著開創我國計算機事業的重要使命。

當時，國內懂計算機的專業人員很少。籌備委員會按照規劃中提出的“先集中，后分散”的組建原則，以中國科學院為主，集中了當時第二機械工業部十局（后來的四機部）、軍委總參三部、國防五院（后來的七機部）和高等院校幾個方面干練的科技力量，全國大協作，共同開拓我國計算技術事業。起步時，租用西苑大旅社（西苑飯店前身）三號樓作為辦公和實驗室的臨時地點。到1956年底計算所籌備委員會集中了314人，組建了計算機整機、元件電路、計算數學三個研究室。1958年2月，計算所遷到了中關村新落成的科研樓。

創業階段的急迫任務是培養我國第一批計算技術專業人才。當時采取了兩方面的措施。一方面派遣科技人員到蘇聯考察計算機、進修和讀研究生，派遣高中畢業生去蘇聯學習計算機知識和技術；另一方面，面向全國抽調高等學校在學的三、四年級學生來北京，開辦為期一年到兩年的計算機訓練班和計算數學訓練班。從1956年到1962年舉辦了四屆，共培養出具有大學本科畢業水平的計算技術專業人員七百多人。通過國內外途徑培養的這批技術人才，就是我國計算機事業初創時期的基本技術隊伍。他們不怕困難，虛心刻苦學習，掌握計算機知識和技術，成為發展我國計算機事業的極其重要的力量。

籌備委員會在計算機研究方面，確定了先仿制，后自行設計的原則。決定引進蘇聯的M-3和БЭСМ-Ⅱ兩臺計算機圖紙資料，邀請蘇聯專家來華指導和幫助，組織國內自己的力量進行生產和調試。結果在短短的兩年間便仿制出了我國第一臺小型電子管數字計算機和第一臺大型通用電子管數字計算機。通過仿制工作的實踐，培植和建立了我國自己的計算機科研隊伍、工業生產隊伍、應用隊伍和管理隊伍。

1958年8月1日，103計算機可以運行短程序，標志著我國第一臺通用數字電子計算機已經誕生，計算技術在我國不再是空白學科。為了紀念這個日子，計算所也把這臺機器稱為八一型計算機。8月3日，人民日報就此事發表了消息。103機是按照蘇聯M-3小型數字電子計算機圖紙資料仿制成功的。它由北京有線電廠（738廠）試制生產，計算所負責調試。1959年，這臺機器經過整頓和改進后，運算速度提高到每秒1800次，在這臺機器上解算了許多科學研究和工程設計中的計算問題，北京人民大會堂主席臺力學結構計算就是在103機上進行的。北京有線電廠將機器定名為DJS-1型計算機并生產了36臺。

104大型數字電子計算機于1959年4月開始試算，人民日報在9月15日進行了報道，國慶節時宣布研制工作完成。平均運算速度為每秒10000次。它是按照蘇聯БЭСМ-Ⅱ大型機仿制成功的。從1957年9月開始，蘇聯科學院派來一組專家，以輪換方式來所幫助調試工作，每期三個月到半年。該機由北京有線電廠和計算所工廠進行生產加工，由計算所進行調試。在這臺計算機上演算過許多重大科學課題，我國第一顆原子彈研制當中的計算任務，軍委測繪總局的大地測量計算任務，鐵路車站最優分布計算，以及5個大型水壩應力計算任務都是在這臺計算機上實現的。北京有線電廠將機器定名為DJS-2型計算機并生產了7臺。

創業期間我所還研制出了我國第一臺自行設計的107通用數字電子計算機，1960年提供給中國科學技術大學使用。

計算所籌備委員會于1959年下半年圓滿完成了科技規劃中提出的各項任務：為全國培養了七百多名急需的計算技術人才；研制成功我國第一臺小型和第一臺大型通用電子數字計算機；率先開始了計算數學和程序設計的研究，并用其成果在電子計算機上完成了國家許多重大工程科學計算任務。所有這些開創性的和里程碑性的成果是全國大協作的結果。這些都是集體智慧的結晶，1959年下半年參加協作的各單位人員相繼返回原單位，開展各自的計算技術研究工作。

經過創業奮斗，計算所自身的科技力量有了很大發展。1959年5月17日，中國科學院第七次院務常務會議通過，正式成立中國科學院計算技術研究所，首任所長閻沛霖。當年底，全所人員達到983人。